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ENCODE at UCSC是由美国国家人类基因组研究所 （NHGRI） 资助的研究小组的国际合作组织。ENCODE 的目标是构建人类基因组中功能元件的综合部分清单，包括作用于蛋白质和 RNA 水平的元件，以及控制细胞和基因活跃环境的调节元件。

ENCODE at UCSC官方网址入口：https://genome.ucsc.edu/ENCODE/

2007 及更高版本的 ENCODE 结果可从 encodeproject.org 的 ENCODE 项目门户获得。 这包括 2007-2012 年和 2013 年至今两个生产阶段生成的数据。ENCODE 项目门户还托管其他 ENCODE 访问工具和 ENCODE 项目页面，包括有关数据发布、出版物和即将推出的教程的最新信息。

从 2003 年成立（试点阶段）到 2012 年全基因组数据生成的第一个 5 年阶段结束，UCSC 为 ENCODE 联盟协调数据。ENCODE 研究人员产生的所有数据和这一时期 ENCODE 分析项目的结果都托管在 UCSC 基因组浏览器和数据库中。使用下面的图像链接或通过左侧菜单栏探索 ENCODE 数据。UCSC 的所有 ENCODE 数据都可以免费下载和分析。